Surgiu em 1967 na França, com o intuito de fazer os alunos colocarem em prática técnicas e conceitos lecionados em sala de aula. A primeira Empresa Júnior da história foi a ESSEC (L'Ecole Supérieure des Sciences Economiques et Commerciales de Paris), em Paris – França.

Em 1988 o movimento chegou ao Brasil através do Sr. João Carlos Chaves, diretor da Câmara de Comércio Franco-Brasileira. Sendo assim em 1990 foi fundada com o objetivo de integrar, desenvolver e representar as Empresas Juniores paulistas (FEJESP).

Em 2001 a Brasil Júnior foi fundada e é a instância que representa as empresas juniores brasileiras, impulsionando a vivência empresarial que elas proporcionam e legitimando-as à sociedade.

E em 2006 com o intuito de unir as Empresas Juniores da Unesp, das mais diversas áreas de atuação e, fortalecer o Movimento Empresa Júnior (MEJ), um grupo de universitários da Unesp (Universidade Estadual Paulista) formou o NEJunesp, que mais tarde foi renomeado para Núcleo Bauru.